Смотря какой флай вы имеете ввиду. Если с помощью читерского софта - то тут уже либо защита стоит на сервере от взлома, либо вы просто криво установили хак. В случае если в обычном сингле - так же, либо криво установили, либо просто забыли включить использование читов в самих настройках мира. Настройки мира можно сменить в любой момент при этом ничего не потеряв, флай в таком случае включается командой /fly, но проще использовать /gamemode. В случае если вы создатель сервера - просто пропишите свой ник-нейм в файлик op в папке сервера.
